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"Une projection de la dynamique de transmission du virus ‘SRAS-CoV-2’ pendant la période post-pandémique de la maladie Covid-19 d’après une étude des chercheurs de l’Université Harvard aux Etats-Unis"

mercredi 15 avril 2020, par Rédaction d’ISIAS


ISIAS Pandémie Coronavirus 2

Une projection de la dynamique de transmission du virus ‘SRAS-CoV-2’ pendant la période post-pandémique de la maladie Covid-19 d’après une étude des chercheurs de l’Université Harvard aux Etats-Unis

Introduction de Wikipédia sur la distanciation sociale

Commentaires : « Une distanciation sociale (prolongée ou intermittente) due au coronavirus pourrait durer jusqu’en 2022 » (Benjamin Fearnow –
source) ; « Il faudra osciller entre confinement et ouverture afin de prévenir une nouvelle vague » (V.G. avec AFP – source).

https://science.sciencemag.org/content/sci/early/2020/04/14/science.abb5793/F6.medium.gif

Extrait – Simulation des scénarios intermittents de distanciation sociale avec la capacité actuelle et élargie de soins intensifs aux Etats-Unis : sans forçage saisonnier (A et C) et avec forçage saisonnier (B et D). La prévalence est en noir et les cas de soins intensifs sont en rouge. À droite de chaque partie principale (E à H), la proportion d’immunisation au fil du temps est représentée en vert avec le seuil d’immunité de la population considérée (barre noire horizontale).

Le rapport initial de Stephen M. Kissler 1,*, et al (ses autres collègues), a été publié le 14 avril 2020 dans Science’ (« revue scientifique généraliste américaine hebdomadaire) ; [eabb5793 – Document ‘science.sciencemag.org’ - DOI : 10.1126/science.abb5793] sous le titre « Report Projecting the transmission dynamics of SARS-CoV-2 through the postpandemic period » et il est accessible sur ce site : https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/14/science.abb5793

Résumé

Il est urgent de comprendre le futur de la transmission du syndrome respiratoire aigu sévère - coronavirus 2 (SRAS-CoV-2). Nous avons utilisé des estimations de la saisonnalité, de l’immunité et de l’immunité croisée pour les bêtacoronavirus OC43 et HKU1 à partir des données de séries chronologiques des États-Unis pour éclairer un modèle de transmission du virus SRAS-CoV-2 ou Coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère

[Notion d’Immunité croisée selon (Lire la bio) Marie-Céline Ray Journaliste -

« L’immunité croisée décrit une immunité acquise contre un agent infectieux qui protège contre un autre agent (virus ou bactérie). L’immunité croisée est liée au phénomène de réaction croisée. En général, un anticorps est spécifique d’un antigène ; mais parfois des anticorps se lient à des antigènes proches (ils sont dits cross-réactifs), parce que ces antigènes possèdent des épitopes communs ou sont de structure similaire. Ainsi, il peut exister des réactions croisées avec des bactéries d’espèces proches. Une bactérie possède de nombreux antigènes de surface. Si un animal est immunisé contre une bactérie grâce à une injection de bactéries entières, il produit des anticorps contre de nombreux antigènes bactériens. Si deux bactéries possèdent un antigène identique, l’animal immunisé contre une bactérie produit aussi des anticorps contre l’autre bactérie ».

Exemples d’immunité croisée

« Le virus de la grippe saisonnière est connu pour muter chaque année, mais ces variations sont souvent mineures. Ceci explique qu’il peut exister une part d’immunité croisée avec des virus rencontrés lors des années précédentes. Plus précisément, le virus influenza porte les protéines hémagglutinine (H) et neuraminidase (N). Les personnes qui ont été exposées à un virus portant un certain type H peuvent être en partie protégées contre des virus du même type. C’est ce phénomène d’immunité croisée qui expliquerait que notre sensibilité aux virus grippaux est liée à notre année de naissance, comme le montrait une étude parue en 2016 : des personnes qui ont déjà rencontré dans leur vie certains virus grippaux seraient mieux protégées que d’autres contre d’autres virus grippaux ». Source : https://www.futura-sciences.com/sante/definitions/medecine-immunite-croisee-16572/ ].

Suite du résumé traduit

Nous avions prévu que des flambées hivernales récurrentes de SRAS-CoV-2 se produiraient probablement après la première vague pandémique la plus grave. En l’absence d’autres interventions, une mesure clé du succès de l’éloignement social est de savoir si les capacités de soins critiques sont dépassées. Pour éviter cela, une distance sociale prolongée ou intermittente peut être nécessaire jusqu’en 2022.

Des interventions supplémentaires, y compris une capacité de soins intensifs s’accumulent et une thérapeutique efficace, améliorent le succès de la distance intermittente et accélèrent qu’ils chercheraient de l’immunité collective. Il est urgent de réaliser des études sérologiques longitudinales pour déterminer l’étendue et la durée de l’immunité contre le SRAS-CoV-2. Même en cas d’élimination apparente, la surveillance du SRAS-CoV-2 devrait être maintenue car une résurgence de la contagion pourrait être possible jusqu’en 2024.

[L’immunité collective  : C’est le niveau de la protection immunitaire d’une population vis-à-vis d’un agent pathogène biologique, dépendant de la proportion de sujets devenus résistants et incluant la diminution de risque d’exposition des sujets demeurés réceptifs]. Source : http://aeema.vet-alfort.fr/index.php/component/glossary/Glossaire-1/I/IMMUNITE-COLLECTIVE-22/ ].

Introduction de l’article traduit

La pandémie actuelle de syndrome respiratoire aigu sévère – coronavirus 2 (SRAS-CoV-2) a causé près de 500.000 cas détectés de maladie à coronavirus 2019 (COVID-19) et fait plus de 20.000 morts dans le monde au 26 mars 2020 (1). L’expérience de la Chine, de l’Italie et des États-Unis montre que COVID-19 peut dépasser même les capacités de soins de santé des pays disposant de ressources suffisantes (2–4). En l’absence de traitements pharmaceutiques disponibles, les interventions se sont concentrées sur la recherche des contacts, la quarantaine et l’éloignement social. L’intensité, la durée et l’urgence requises de ces réponses dépendront à la fois du déroulement de l’onde pandémique initiale et de la dynamique de transmission subséquente du SRAS-CoV-2.

Pendant la première vague pandémique, de nombreux pays ont adopté des mesures de distanciation sociale et certains, comme la Chine, les lèvent progressivement après avoir atteint un contrôle adéquat de la transmission. Cependant, pour atténuer la possibilité de résurgences d’infection, des périodes prolongées ou intermittentes de distanciation sociale peuvent être nécessaires. Après la première vague pandémique, le SRAS-CoV-2 pourrait suivre son plus proche parent génétique, le SRAS-CoV-1, et être éradiqué par des mesures intensives de santé publique après avoir provoqué une épidémie brève mais intense (5). De plus en plus, les autorités de santé publique considèrent ce scénario peu probable (6).

Alternativement, la transmission du SRAS-CoV-2 pourrait ressembler à celle de la grippe pandémique en circulant de façon saisonnière après avoir provoqué une première vague mondiale d’infection (7). Un tel scénario pourrait refléter l’émergence précédente de coronavirus humains connus d’origine zoonotique, par ex. coronavirus humain (HCoV) OC43 (8). La distinction entre ces scénarios est essentielle pour formuler une réponse de santé publique efficace et soutenue au SRAS-CoV-2.

La dynamique de transmission pandémique et postpandémique du SRAS-CoV-2 dépendra de facteurs tels que le degré de variation saisonnière de la transmission, la durée de l’immunité et le degré d’immunité croisée entre le SRAS-CoV-2 et d’autres coronavirus, comme ainsi que les événements et le calendrier des mesures de contrôle.

SARS-CoV-2 appartient au genre betacoronavirus, qui comprend le coronavirus SARS-CoV-1, le coronavirus MERS et deux autres coronavirus humains, HCoV-OC43 et HCoV-HKU1. Les coronavirus SARS-CoV-1 et MERS provoquent des maladies graves avec des taux de létalité approximatifs de 9 et 36% respectivement, mais la transmission des deux est restée limitée (9).

Les infections par HCoV-OC43 et HCoV-HKU1 peuvent être asymptomatiques ou associées à une maladie des voies respiratoires supérieures légère à modérée ; ces HCoV sont considérées comme la deuxième cause la plus fréquente de rhume (9). Le HCoV-OC43 et le HCoV-HKU1 provoquent des flambées hivernales annuelles de maladies respiratoires dans les régions tempérées (10, 11), ce qui demande que le climat hivernal et les comportements de l’hôte puissent faciliter la transmission, comme c’est le cas pour la grippe (12-14). L’immunité au HCoV-OC43 et au HCoV-HKU1 semble diminuer considérablement en un an (15), tandis que l’infection par le SRAS-CoV-1 peut induire une immunité plus durable (16).

Les bétacoronavirus peuvent induire des réponses immunitaires les uns contre les autres : l’infection par le SRAS-CoV-1 peut générer des anticorps neutralisants contre le HCoV-OC43 (16) et l’infection par le HCoV-OC43 peut générer des anticorps à réaction croisée contre le SARS-CoV-1 (17).

Alors que les enquêtes sur le spectre des maladies demandées par le SRAS-CoV-2 sont en cours, des preuves récentes produites que la majorité des cas souffrent d’une maladie légère à modérée avec une occurrence plus limitée d’infections respiratoires tombes graves (18). On estime que les taux de létalité COVID-19 actuels se situent entre 0,6% et 3,5% (19, 20), ce qui a une gravité plus faible que le SRAS-CoV-1 et le MERS mais une gravité plus élevée que le HCoV-OC43 et le HCoV-HKU1. La forte infectiosité au début des symptômes souvent bénins rend le SARS-CoV-2 beaucoup plus difficile à contrôler avec des interventions sur des cas tels que des tests intensifs, l’isolement et le traçage, par rapport aux coronavirus SARS-CoV-1 et MERS (21).

[Introduction de Wikipédia sur l’infectiosité (angl. infectiousness) (esp. infecciosidad) (ital. contagiosità) (portug. infecciosidade/infeciosidade) (roum. infecţiozitate)

  • Caractère de ce qui est infectieux.
  • Aptitude d’une maladie infectieuse à se transmettre plus ou moins facilement.
  • Degré de richesse en agents infectieux d’une source infectieuse.
    Remarque 1 : ce concept peut s’appliquer à toutes les maladies infectieuses et pas seulement à celles d’entre elles qui sont contagieuses (pour lesquelles on évoque la « contagiosité ») ; ainsi, les arboviroses ont une contagiosité faible à nulle et une forte infectiosité.

Remarque 2 : à ne pas confondre avec « l’infectivité » : cette dernière correspond à la phase d’ « entrée » dans l’hôte (aptitude à déclencher une infection par un nombre plus ou moins élevé d’unités d’un agent infectieux) alors que l’infectiosité correspond à la phase de « sortie » de l’hôte (quantité plus ou moins importante d’unités de l’agent infectieux produites par l’hôte et disponibles pour la transmission).

Remarque 3 : a une durée variable en fonction des maladies : « période d’infectiosité ».

Remarque 4 : cf. figure Contagiosité. Voir contagiosité, période d’infectiosité - Source : http://aeema.vet-alfort.fr/index.php/component/glossary/Glossaire-1/I/INFECTIOSITE-183/ ].

Suite de l’introduction traduite

Des tests intensifs et des interventions basées sur des cas ont jusqu’à présent constitué la pièce maîtresse des efforts de contrôle dans certains endroits, tels que Singapour et Hong Kong (22). De nombreux autres pays adoptent des mesures appelées « distanciation sociale » ou « distanciation physique », fermant les écoles et les lieux de travail et limitant la taille des rassemblements. L’objectif de ces stratégies est de réduire l’intensité maximale de l’épidémie (« aplatir la courbe ») (22), de réduire le risque de submerger les systèmes de santé et de gagner du temps pour développer des traitements et des vaccins. Pour que la distanciation sociale ait inversé l’épidémie en Chine, le nombre de reproducteurs effectifs doit avoir diminué d’au moins 50 à 60%, en supposant un R0 de référence compris entre 2 et 2,5 (22).

Grâce à des mesures de contrôle intensives, Shenzhen a pu réduire le nombre de reproductions effectives d’environ 85% (23). Cependant, on ne sait pas dans quelle mesure ces baisses de R0 pourraient se généraliser à d’autres paramètres : des données récentes de Seattle suggèrent que le nombre de reproduction de base n’a baissé qu’à environ 1,4, ou d’environ 30 à 45% en supposant un R0 de base entre 2 et 2,5 (24). En outre, les mesures de distanciation sociale peuvent devoir durer des mois pour contrôler efficacement la transmission et atténuer les risques de résurgence (25).

Une mesure clé du succès des interventions de distanciation sociale est de savoir si les capacités de soins critiques sont dépassées. Des études de modélisation (26) et de l’expérience de l’épidémie de Wuhan (2) qui montrent que les capacités de soins intensifs, même dans les pays à revenu élevé, peuvent être dépassées plusieurs fois si les mesures de distanciation ne sont pas mises en œuvre rapidement ou assez fortement.

Pour atténuer ces problèmes, les approches visant à accroître la capacité de soins intensifs ont inclus la construction rapide ou la réorientation des installations hospitalières et le prix en compte de l’augmentation de la fabrication et de la distribution des ventilateurs (27-30). Les traitements qui réduisent la proportion d’infections localisées à une maladie grave pourraient avoir un effet similaire à celui du fardeau des systèmes de santé.

Cet article identifie les facteurs viraux, environnementaux et immunologiques qui, en combinaison, déterminent la dynamique du SRAS-CoV-2. Nous intégrons nos résultats dans un modèle mathématique pour le projeteur des scénarios potentiels de transmission du SRAS-CoV-2 pendant les périodes pandémiques et post-pandémiques et identifions les données clés encore nécessaires pour déterminer les scénarios potentiels susceptibles de se jouer. Ensuite, à l’aide du modèle, nous évaluons la durée et les mesures de distanciation sociale qui pourraient être nécessaires pour maintenir le contrôle du SRAS-CoV-2 dans les mois à venir dans le cadre des capacités existantes et élargies de soins intensifs…

L’article complet avec tous les documents associés et les références sont à lire (en anglais) sur ce site : https://science.sciencemag.org/content/early/2020/04/14/science.abb5793

Accès aux détails de la publication en anglais : Article Abstract Transmission dynamics of HCoV-OC43 and HCoV-HKU1 Simulating the transmission of SARS-CoV-2 Assessing intervention scenarios during the initial pandemic wave Discussion Supplementary Materials References and Notes Figures & Data Info & Metrics eLetters PDF

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[
Introduction de Wikipédia sur la distanciation sociale

La distanciation sociale, ou distanciation physique1 ou éloignement sanitaire1 (en anglais : social/physical distancing) désigne certaines mesures non pharmaceutiques de contrôle des infections prises par les responsables de la santé publique pour arrêter ou ralentir la propagation d’une maladie très contagieuse comme par exemple les maladies infectieuses émergentes et qui visent à éloigner les individus les uns des autres. L’objectif de la distanciation sociale est de réduire la probabilité de contacts entre les personnes porteuses d’une infection et d’autres personnes non infectées, de manière à réduire la transmission de la maladie, la morbidité et la mortalité2. Elle participe à la réduction des risques sanitaires. La distanciation sociale est la plus efficace lorsque l’infection peut être transmise par contacts de gouttelettes (toux ou éternuements) ; par contact physique direct, y compris sexuel ; par contact physique indirect (par exemple en touchant une surface contaminée) ; ou par transmission aérienne (si le micro-organisme peut survivre dans l’air pendant de longues périodes)3. La distanciation sociale est moins efficace dans les cas où l’infection est transmise principalement par de l’eau ou des aliments contaminés ou par des vecteurs tels que les moustiques ou autres insectes, et moins fréquemment de personne à personne4. Les inconvénients de la distanciation sociale peuvent inclure la solitude, la réduction de la productivité (partiellement compensée par le télétravail et les téléconférences5) et la perte d’autres avantages liés aux interactions humaines. Dans les endroits où l’accès à la technologie est réduit, elle peut également rendre plus difficile le suivi de la santé d’une population… » - Article complet à lire sur ce site : https://fr.wikipedia.org/wiki/Distanciation_sociale ]

[Commentaire traduit par Jacques Hallard : « Une distanciation sociale due au coronavirus pourrait durer jusqu’en 2022, selon une étude de Harvard Par Benjamin Fearnow le 14/04/20 à 17:40 EDT].

Une étude de l’Université Harvard publiée mardi 14 avril 2020 a révélé que des périodes de distanciation sociale pourraient être nécessaires pendant deux ans en 2022 afin d’empêcher que les futures épidémies saisonnières de COVID-19 n’écrasent le système de santé américain.

Des chercheurs du T.H. de l’Université Harvard L’école de santé publique de Chan a analysé des scénarios dans lesquels une vague de personnes malades du nouveau coronavirus pourrait écraser les hôpitaux et les travailleurs médicaux des soins intensifs du pays. L’analyse comprenait des variables indiquant si les personnes infectées par un coronavirus ont développé une immunité à court terme (un an) ou à plus long terme contre les résurgences à venir.

Les chercheurs ont prévu qu’une épidémie hivernale ’se produira probablement’ après l’éclosion initiale ’la plus grave’ de ce printemps, et il est possible que les capacités de soins critiques soient dépassées et incapables de fournir un traitement à de nouvelles vagues de patients positifs.

Les chercheurs ont reconnu l’énorme préjudice économique que la pandémie de COVID-19 a causé aux États-Unis et dans le monde. Ils ont déclaré que leur recherche, publiée mardi dans la revue Science, n’approuve aucune politique particulière, mais considère plutôt la viabilité des options alternatives pour prévenir un ’fardeau catastrophique pour le système de santé’.

« En l’absence d’autres interventions, une mesure clé du succès de la distanciation sociale est de savoir si les capacités de soins critiques sont dépassées. Pour éviter cela, une distanciation sociale prolongée ou intermittente peut être nécessaire jusqu’en 2022 », ont écrit les chercheurs de la ‘Harvard School of Public Health’ dans l’analyse publiée cette semaine.

’Nous avions prévu que des flambées hivernales récurrentes de SRAS-CoV-2 se produiront probablement après la première vague pandémique la plus grave’, ont poursuivi les chercheurs. ’Des interventions supplémentaires, y compris une capacité de soins intensifs accrue et un traitement efficace, amélioreraient le succès de la distance intermittente et accéléreraient l’acquisition de l’immunité collective ... Même en cas d’élimination apparente, la surveillance du SRAS-CoV-2 devrait être maintenue car un une résurgence de la contagion pourrait être possible jusqu’en 2024. ’

SARS-CoV-2 est le nom du virus qui cause la maladie COVID-19.

Les chercheurs ont noté que divers degrés de transmission saisonnière et la poursuite de celle-ci avec de faibles taux de mortalité auront un effet majeur. Mais ils ont tout de même averti que « l’expérience de la Chine, de l’Italie et des États-Unis démontre que COVID-19 peut dépasser les capacités de soins de santé des pays disposant de ressources suffisantes ».

En ce qui concerne l’effet dévastateur que le verrouillage de la pandémie a eu sur l’économie américaine, les auteurs de l’étude de Harvard ont déclaré qu’ils ne prenaient pas position pour ou contre la discussion de mettre fin à la distance sociale dans un avenir proche.

’Notre objectif dans la modélisation de telles politiques n’est pas de les approuver, mais d’identifier les trajectoires probables de l’épidémie selon des approches alternatives’, ont-ils écrit. ’Nous ne prenons pas position sur l’opportunité de ces scénarios étant donné le fardeau économique qu’une distanciation soutenue peut imposer, mais nous notons le fardeau potentiellement catastrophique pour le système de santé qui est prévu si la distanciation est peu efficace et / ou n’est pas maintenue pendant longtemps assez.’

Correction (15/04/20, 03h00 HE) : Une version précédente de cet article disait que le SRAS-CoV-2 était également connu sous le nom de COVID-19. Cela a été corrigé pour indiquer que le SRAS-CoV-2 est le virus qui cause la maladie COVID-19. © 2020 Newsweek – Source : https://www.newsweek.com/social-distancing-due-coronavirus-could-last-2022-harvard-study-finds-1497886

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Traduction, ajout de [compléments] et intégration de liens hypertextes : Jacques HALLARD, Ingénieur CNAM, consultant indépendant 15/04/2020

Site ISIAS = Introduire les Sciences et les Intégrer dans des Alternatives Sociétales

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Fichier : ISIAS Pandémie Coronavirus 2 Projecting the transmission dynamics of SARS-CoV-2 through the postpandemic period French version.3

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